ДНК-тест в разных компаниях

[Ольгея]

Нашла интересную статью за ноябрь 2019 года. Автор заказывал ДНК-тест в разные лаборатории и сравнивал результаты. Думаю, что информация многим будет полезна. Правда в комментариях разгорелись баталии, многие не согласны с выводами автора и дополняют своей информацией

ДНК-тест в десяти разных компаниях на примере моего собственного

Как я сделал анализ и расшифровку ДНК в «Атласе», Genotek, 23andMe, MyHeritage и ещё в шести сервисах — и что из этого вышло.

Нет, у меня не было задачи делать такое сравнение. Изначально я, заинтересовавшись своим происхождением и заполняя генеалогическое древо на MyHeritage, много раз видел баннер с предложением купить тест ДНК. Несколько недель он мне мозолил глаза, и в какой-то момент я все же клюнул на распродажу и заказал тесты себе и семье.

Пока мне почтой из США шли тесты, я начал изучать сайты и форумы с целью понять, что за зверь такой — ДНК-тесты. Оттуда я понял, что заказанный мной тест в MyHeritage не самый удачный, так как предполагал только неполные данные о происхождении и в нем отсутствовала интерпретация данных о здоровье. А почитав примеры, я понял, что тоже хочу знать больше о своем здоровье.

Ну а там опять начались распродажи. И докупил еще тестов в других лабораториях, даже не дождавшись результатов первого.

Хотя я также покупал тесты жене, детям и другим родственникам в разных лабораториях, сравнивать буду на примере своего.

Я перебрал все самые популярные в России и мире тесты. Глобально можно выделить два направления: происхождение и здоровье. В каких-то сервисах есть только происхождение, в каких-то только здоровье, некоторые содержат и то, и то.

Итого биоматериал я сдал в четырех лабораториях:

• MyHeritage
• 23andMe
• Genotek
• «Атлас»

Взяв сырые данные, я расшифровывал и интерпретировал их в еще шести сервисах:

• FamilyTreeDNA
• Promethease
• genesis.gedmatch.com
• Codegen
• Genomelink
• Sequencing

В «Атласе», помимо классического ДНК-теста, я сделал еще ДНК-микробиоты. Если будет интересно — напишите, сделаю по нему отдельный материал.

Как происходит сдача биоматериала

Вам присылают специальный сосуд, вы туда сплевываете слюну до деления, заливаете консервирующим раствором из комплекта и отправляете обратно. В случае MyHeritage там не сосуд со слюной, а соскоб с внутренней поверхности щек. Все это самостоятельно, по простой инструкции.

Какие есть нюансы по доставке:

• 23andMe. Самый сложный тест, так как он не отправляется в Россию в принципе. Пришлось заказывать через посредника, который еще не забанен компанией. Также нельзя из России отправлять обратно. Поэтому пришлось попросить знакомых, которые летели в Амстердам, чтобы они бросили коробку с биоматериалом в местный почтовый ящик. Если же вы отправите из России, 23andMe может аннулировать ваш аккаунт. Я читал о таких случаях, поэтому решил не рисковать.
• MyHeritage. Отправляют в Россию без проблем. И даже бесплатная доставка от двух комплектов. Но отправить обратно придется за свой счет. Лайфхак: обычной «Почтой России» дошло за неделю до Хьюстона (где находится лаборатория MyHeritage). А вот EMS-отправление шло три недели. И это при разнице в цене в 20 раз не в пользу EMS!
• «Атлас» и Genotek. Никаких проблем и долгих ожиданий. Привозит и забирает курьер. Хотя я в «Генотек» заехал лично, у них в специальном кабинете с женой наплевали, чтобы не ждать курьеров. Но эти тесты и самые дорогие.

Итак, к результатам. Давайте начнем с происхождения.

Вводные: сам я русский, родился на Дальнем Востоке, мои мама и папа тоже с Дальнего Востока. По одной линии дед и бабушка с Краснодарского края, по другой — из Сибири и Алтайского края. Все русские.

Происхождение в тесте MyHeritage
Здесь вообще территория России почти не используется. Но даже абстрагируясь от непонятного расположения ареалов восточно-европейцев, почему прибалтов у меня 33%, непонятно. Прибалтов точно в роду не было. У жены тоже прибалты. Хотя она и ее родственники совсем из других регионов. Видимо, особенности работы алгоритмов MyHeritage.

Еще MyHeritage — единственный сервис, который увидел во мне немного еврея (1,5%). Но это особенность именно этого сервиса, он родом из Израиля и многим завышает показатель по ашкенази.

В тесте не содержится сведений о гаплогруппах.

По итогу в MyHeritage — очень странное и бестолковое происхождение. Пустая трата денег. Из полезного только сырые данные, которые можно потом интерпретировать.

Количество найденных родственников — 3241 человек. Из России — 89.

Происхождение в тесте 23andMe
А здесь уже что-то похожее на правду. 86,5%, что восточно-европеец. Вот сильно похоже. Остальные цифры ничего не значат. Все показатели ниже 5% обычно воспринимаются как шум и не учитываются.



То есть здесь 23andMe «угадал». Но сделать это было несложно, учитывая, что сервис попросил меня заполнить анкету перед выдачей результатов. Там был вопрос о происхождении, я решил не врать и честно написал, что из России.

Но здесь можно кликнуть на блок восточно-европейцев и получить расклад по регионам.



А вот это уже интереснее. Здесь подсвечены регионы, в которых жили мои предки. Это настолько похоже на правду, что даже пугает.

Гаплогруппа по отцовской линии R-L260 (R1a1a1b1a1a) и по материнской линии H6a1a.



Есть просмотр древних предков по каждой из материнской И отцовской гаплогрупп.

Количество найденных родственников — 1248. Из России — 36.

Происхождение в тесте Genotek
Здесь нет карты. И нет процентов какой-то нации. Здесь просто вероятности, кем я могу быть.



С точки зрения Genotek я могу быть с одинаковой вероятностью литовцем, белорусом, поляком, украинцем, шведом, русским, эстонцем, хорватом и молдаванином. В общем, точность прогноза самая низкая из всех тестируемых вариантов. Честно говоря, еще один бестолковый тест. Особенно учитывая, что у меня и у жены результаты одинаковые.

Гаплогруппа по отцовской линии R1a1a1b и по материнской линии H6a1a.



В Genotek есть карта пути следования моих гаплогрупп по отцовской и материнской линиям.

Количество найденных родственников — 14. Все из России.

Происхождение в тесте «Атласа»
Тут красивая карта ареалов. Вроде бы, тест российской компании, но ареал обитания русских только в западной части страны. За Уралом, видимо, русские не живут, по мнению «Атласа».



Еще непонятно соотношение. Чехов с венграми во мне больше, чем русского. Ну, странная тема.

Гаплогруппа по отцовской линии R1a1a1 и по материнской линии H6a1a4.



Здесь есть очень красивая карта отцовской и материнских линий гаплогрупп. Но почему-то не до конца провели их

Родственников не ищет (или я не нашел где).

Происхождение в тесте FamilyTreeDNA

На этот тест я уже не сдавал слюну, а загрузил сырые данные и оплатил интерпретацию.



Удивительное рядом. Граница Восточной Европы проходит четко по границам России. Огромный процент Южной Европы не соответствует моим наблюдениям и другим тестам. Точность теста низкая. Здесь есть серое облако на Дальнем Востоке — это 3%, что обычно считается погрешностью и не учитывается в результатах.

Количество найденных родственников — 933. По месту сортировки нет.

Происхождение в GEDmatch
Здесь нет красивой карты. Да и результаты будут меняться в зависимости от алгоритма, который используем. Я час гонял разные алгоритмы и нашел параметры, по которым происхождение было похоже на мое. Но считаю некорректным подгон результатов. Поэтому выкладываю стандартный распространенный алгоритм.

По нему я наиболее близок к молдаванину, затем к немцу, хорвату, словаку, украинцу и другим. В общем, мимо.



Из плюсов: GEDmatch — единственный бесплатный тест в подборке по происхождению.

Количество найденных родственников — более 3000 (отображаемый максимум). По месту сортировки нет.

Выводы по происхождению
По разбросу результатов понятно, что еще есть куда расти алгоритмам. С чем справились все тесты — поняли, что я как-то связан с Восточной Европой. Причем в некоторых тестах моя страна не входит в Восточную Европу.

До обновления 23andMe я вообще решил, что все это происхождение по ДНК — гадание на кофейной гуще. Но после обновления 23andMe он стал единственным тестом, который выдал результаты, близкие к реальным. Также это единственный тест, показывающий разбивку по регионам России (с неплохой точностью).

Можно было бы все свести к неточности алгортимов. Но что меня удивило — в разных тестах немного различаются мои гаплогруппы.

Например, в 23andMe самая длинная по мужской линии, а в «Атласе» — по женской. Еще раз, я не являюсь генетиком. Но что-то мне подсказывает, что может такой разброс в точности определения происхождения связан не только с плохими алгоритмами, но и разницей в вводных данных, которые получаются после секвенирования моего ДНК.

Здоровье
Разбор по здоровью можно прочитать в самом первоисточнике, сюда не буду переносить https://vc.ru/life/90971-dnk-test-v-desyati-raznyh-kompaniyah-na-primere-moego-sobstvennogo

Автор Алексей Гончаров

[СергейКорнилов]

Интересная статья, спасибо!

[Михаил Михайлович]

Непонятно, что исследовал автор исследования, какие задачи перед собой ставил и какие конкретно  тесты он сдавал. Наличие большого количества лабораторий ни о чем не говорит, тем более, что автор не ставил перед собой задачу сравнивать их результаты. Тесты  ДНК (DNA) подразделяются не на происхождение и здоровье, как пишет автор, а  на предмет исследования хромосом. Их всего три: аутосомный тест, мито тест (mtDNA) и Y-DNA тест.
Аутосомный тест исследует 22 парные хромосомы (без учета половых хромосом: XX - у женщин и YX - у мужчин). По результатам этого теста можно подтвердить ближайшее родство (отец, мать, сын, дочь, бабушка, дедушка) и ВОЗМОЖНЫХ родственников (например, 3 – 6 юродных братьев и сестер). Это всего лишь возможные родственники, с которыми у вас просто совпали  отдельные «кусочки» хромосом, не более того. Когда вам сообщат, что кто-то обнаружил по результатам теста 1000 и более родственников, отнеситесь к этому снисходительно. Этот тест, в основном, представляет интерес для воспитанников детских домов, усыновленных (удочеренных), либо разлученных в детстве людей. Это реально поможет найти близких родственников. При этом, сведения о ДНК ищущих и искомых должны находятся в одной и той же базе данных (например, в My Heritage, Family Tree DNA или GED Match).

Аутосомный тест НЕ ОПРЕДЕЛЯЕТ НАЦИОНАЛЬНОСТЬ! Он указывает на возможное процентное отношение к тому или иному этносу. Причем 5% и менее можно отнести к так называемому «фоновому шуму», т.е. просто не учитывается. Первое время эти таблицы и картинки производили на меня какое-то впечатление, но скоро всё это показалось слишком оторванным от реальности. К этой белиберде я окончательно остыл и больше не возвращался.

Хочу показать, как у меня это определяют My Heritage, Family Tree DNA или GED Match. Это никак не отменяет записанную в свидетельстве о рождении национальность – русский! 







На сайте https://mytrueancestry.com/ можно сравнить результаты совпадений вашего аутосомного теста ДНК с образцами ДНК древних людей, останки которых были изучены. Тут у вас найдутся совпадения с сарматами, скифами, аварами и т.д. и т.п. Вот, например, как у меня, но это не означает, что они действительно мои прямые родственники.



Митохондриальный тест (mtDNA) определяет наследование Х-хромосомы, передаваемой по материнской (женской) линии. Передается от матери к дочери и далее, а также от матери к сыну без продолжения. По результатам этого теста можно узнать свою mtDNA гаплогруппу и гаплотип, исследовать снипы (SNPs). Зарегистрировавшись на сайте YFull (mt), загрузив файл с результатами теста можно узнать своё расположение на дереве.  Но этот тест менее информативен, чем тест Y-DNA.

Тест Y-DNA, по-моему, самый интересный тест ДНК. Y-хромосома передаётся от отца к сыну и далее исключительно по мужской линии. Здесь мужчинам повезло больше, чем женщинам. Изучая совпадения по STR и SNP, сделав тест BigY DNA, здесь можно выйти на конкретного  далёкого родственника, основателя рода. Тесты ДНК, конечно, необходимо подтвердить архивными документами. И здесь тест ДНК, в случае сомнений или неясностей в правильности или подлинности документов, может сыграть решающую роль.

Моё отношение к схемам о миграции Y и mt гаплогрупп более сдержанное. Это безусловно интересно, но это не более, чем гипотеза.

Хотите серьёзно разбираться в ДНК  - общайтесь с профессионалами и всеми интересующимися в этой сфере на научно-популярном интернет-ресурсе Молекулярная генеалогия http://forum.molgen.org/. Успехов!


 

[Михаил Михайлович]

Что касается теста "Здоровье", то он делается на базе того же аутосомного теста. Сдав тест в My Heritage (они делают только аутосомные тесты), можно заказать на основе уже имеющегося анализа тест о здоровье. Данный, модный в настоящее время тест, не заменяет медицинскую карту пациента. Этот тест показывает наличие или отсутствие гена, ответственного  за определённую, скажем так, медицинскую предрасположенность (не здоровье!) человека. Например, отсутствие определённого гена говорит о бесплодии человека.

Однако, Family Tree DNA в отличие от My Heritage, делает не только аутосомный тест, именуемый Family Finder, но и тесты mtFull Sequence, Y-DNA37-111 (отдельные тесты от 37 до 111 маркеров), BigY-700. Обе компании пользуются услугами одной лаборатории, расположенной в Хьюстоне (США). Обе компании обеспечивают доставку тест-наборов в Россию. Отправка анализов заказной почтой из России без проблем. Качество тестов хорошее, пока экономически выгоднее, чем делать тесты в России. Лучше всего делать заказы во время больших скидок: день ДНК, день отца, летние авустовские скидки, чёрная пятница в ноябре-декабре, рождественские скидки. Я всё сделал в обеих компаниях по максимуму. Результатами доволен.

Для начала рекомендую сделать аутосомный тест в My Heritage, а затем сделать трансфер и за доплату в $19 получить Family Finder в  Family Tree  DNA. Так получится во первых дешевле, во вторых у вас будут совпаденцы (приближенцы) - matches в базах обеих компаний.

Ещё один немаловажный аспект. My Heritage, по моему мнению, позволяет создать самое подробное и интересное в информативном плане фамильное дерево. Можете попробовать создать, не пожалеете.
 

[Михаил Михайлович]

Хочу уточнить свою позицию по затронутой теме о происхождении. Каждый исследователь своей родословной хочет узнать представители каких народов и этнических групп были его предками, кто конкретно  дал начало его роду. Я тоже, естественно, задался такой целью. Что я знал о своих ближайших предках ? Предки по материнской линии с Верхней Волги из Ярославской губернии, предки по отцовской линии из Забайкалья. Самые старые известные предки: по материнской линии мой прадед 1870 года рождения, по отцовской линии дед 1881 года рождения.
Сдав аутосомный тест я получил результаты, которые приводил ранее. Данные «о происхождении» рассчитываются и составляются с помощью так называемых этнокалькуляторов. Если человека и его ДНК создал Господь Бог, то этнокалькуляторы смастерил человек или группа авторов. Для расчетов, закладываемых в этнокалькуляторы, используются данные ДНК, полученные и накопленные за предыдущие годы исследований ДНК. Почему у меня по расчётам одного из этнокалькуляторов финнов 20% ? Да по одной простой причине, что на определённую дату в маленькой Финляндии тесты ДНК сдали около 35 тысяч человек, а со всей России набралось чуть более 7 тысяч, причём преимущественно из центральной и северо-западной части страны. В последней у нас также проживают представители народностей, принадлежащих к фино-угорской группе. На картах My Heritage ареал китайцев грубо распространён на всю юго-восточную Азию, а ареал эскимосов охватывает территорию от северо-восточной Сибири до Гренландии включительно. По этой причине буряты, нанайцы и прочие наши северные народы будут отнесены либо к китайцам c вьетнамцами, либо к эскимосам. На результатах значительно сказывается и чисто субъективный подход разработчиков этнокалькуляторов в их произвольном «расселении» этносов на поверхности Земли. Матчи на Family Finders FT DNA у меня показывают то же самое: «родственники» из Финляндии явно преобладают. С аутосомоми по-моему всё ясно.
Теперь о моих исследованиях Y-хромосомы. На Family Tree DNA я последовательно сдал и проапгрейдил тесты начиная с Y-37 DNA  до Y-111 DNA и закончил тестом  BigY-700 (самый глубокий, предназначен для экспертов). Результаты меня обескуражили. Здесь  «чудес», аналогичных аутосомным тестам на предмет происхождения не бывает. Ранее я полагал, что мои предки по отцовской  линии исконно русские с небольшой примесью местных инородцев из казаков или крестьян, возможно первопроходцев, осваивавших Сибирь. Первые результаты тестов Y-DNA показали, что я отношусь к гаплогруппе G2a1, представленной в основном кавказцами. На 37 маркерах STR у меня в совпаденцах оказалось 90% осетин. Причём на 67 маркерах в двух шагах у меня был Ахмет Дударов, известная историческая личность, а в 3-х шагах Иосиф Джугашвили (Сталин по отцу был осетином, что подтвердил тест Y-ДНК, сделанный его внуком).   Не буду вдаваться в подробности, но дальнейшие исследования показали, что мой далёкий предок был осетином-иронцем из Тагаурского общества и потомком алан из ос-багатаровской ветви последнего аланского царя. Это надо как-то объяснить. По одной из версий, мой предок осетин, давший начало моему роду Петровых, был беглым каторжником, сосланным в Сибирь или Манчжурию после подавления восстания на Кавказе в конце XVIII – начале XIX в.в. Вожаками восстаний были как раз Дударов и Шанаев (обе фамилии присутствуют у меня в совпаденцах), а также их родственники, принадлежащие к Тагаурскому обществу. Теперь пытаюсь подтвердить это с помощью документов из ГАЗК, а в дальнейшем из ГАРСО-А.
По результатам теста Family Finder FT DNA аутосомы осетинских предков со временем были практически полностью размыты. В matches нашёлся лишь один осетинский совпаденец, зато достаточно известный – Алан Березов.   
Резюме. Результаты аутосомного теста подчас не совпадают с результатами теста Y-DNA (и не только у меня, имеются ещё примеры). Если у теста Y-DNA ошибка практически исключена (не будем принимать во внимание случаи ложного отцовства или усыновления), то результаты аутосомных тестов, исходя из вышесказанного, очень часто под большим сомнением. Как говорят французы, ву а ля. Выводы делайте сами.

[Ольгея]

Михаил Михайлович, спасибо за такой развёрнутый ответ! Буду изучать и вникать подробно в этот вопрос

[Михаил Михайлович]

Да, это действительно очень интересно. Ещё совсем недавно я сам  имел очень поверхностные знания в этих вопросах. Зайдите на сайт Молекулярная генеалогия, хотя бы ради интереса. Посмотрите, что к чему. Зарегистрировавшись на форуме, сможете сами задавать вопросы. Через некоторое время станете не профессионалом, но достаточно сведущим человеком. Будете отличать правду от всего наносного. Сейчас много спекуляций на тему ДНК. А так будете иметь собственное мнение. Успехов Вам!

[Михаил Михайлович]

Ну вот, перед Новым Годом хочу повеселить уважаемых форумчан. У нас по стране гуляет такая байка, что, мол тесты ДНК - это не что иное как сбор биоматериала западными спецслужбами с целью создания биологического оружия против наших граждан. Так вот, конкретно мой защёчный биоматериал позволит создать такое оружие, которое напрочь уничтожит военных блока НАТО и прочих наших врагов, потому что, судя по данным этнокалькуляторов, у меня в слюне : 60% прибалтов, 20% финнов, 9% жителей Британских островов и других недругов из ЕС и США, но почти нет граждан России. 

Всех с наступающим 2020 Новым Годом!!! Мира и процветания!!!

[СветланаФ]

Да, Михаил Михайлович, на что только не идут коммерсанты, чтобы уменьшить количество клиентов у конкурентов. Спасибо за независимый анализ этих предложений и отзыв.

[Михаил Михайлович]

Всё хорошо Светлана Геннадьевна, если бы не одно НО. Все эти тесты ДНК и дополнительное размещение результатов на специальных сайтах  довольно дорогое удовольствие. Далеко не каждый из нас может выделить деньги на это дело из семейного бюджета. Мне, не работающему пенсионеру, благодаря определённым благоприятным обстоятельствам это удалось сделать, к счастью.

[СветланаФ]

Да, к сожалению, это так.
Но многие вообще не понимают зачем все эти исследования, не только ДНК, но и генеалогические.
И не только потому, что не стремятся узнать про своих предков.
Просто в стране большая часть людей озабочена выживанием, а также изучением огромного количества "бреда", которое ежедневно в виде законов и подзаконных актов выливается на головы рядовых жителей. Надо быть подкованным инженерно, чтобы выжить с ЖКХ, медицински грамотным, чтобы не навредили, а также юридически подкованным, чтобы не обманули.